自1993年开始招收环境保护类专科生，1996开始招收农业环境保护本科生，2002年和2004年开始以“环境科学”、“环境工程”专业招收本科生，2016年加设环境科学国际班。

 1996年获农业环境保护硕士学位授权，1998年专业调整更名为环境工程。2006年获得环境科学与工程一级学科硕士学位点。2004年在农业资源与环境一级学科下设立了“农业环境保护”二级学科博士点。

环境科学与工程下设环境科学和环境工程2个学科专业，其中（1）环境工程的主要研究方要有：污染环境修复技术、固废处理与资源化技术、水污染控制工程、有机污染控制技术、环境工程生物技术。（2）环境科学的主要研究方向有：土壤环境学、水污染防治技术与理论、有机污染控制化学、土壤污染生态学。专业硕士学位：资源利用与植物保护，研究方向为农业环境保护。

目前，该学科成员共有30人，其中教授（博士生导师）7人、副教授15人，高级工程师2人，高级实验师1人。专职教师中：具有博士学位的专职教师占比93%；二级教授2人；国家杰青基金项目获得者1人；教育部高等学校环境科学与工程类专业教学指导委员会委员1人；广东省本科高校环境科学与工程类专业教学指导委员会主任委员1人、委员1人；科技部“十三五”国家重点研发计划“场地土壤污染成因与治理技术”重点专项总体专家组专家1人；世界银行贷款广东省农业面源污染治理项目牲畜废弃物治理首席专家1人；广东省珠江青年拔尖人才1人；中国土壤学会副理事长1人、土壤环境专业委员会副主任1人；广东省土壤学会常务理事1人、理事1人；广东省环境科学学会副理事长1人、理事2人；广东省环境科学学会农业环境保护专业委员会主任委员1人。

现有环境科学（含国际班）和环境工程两个专业本科生近600人。核心课程涉及水污染与控制、大气污染与控制、固体废物处理处置、环境土壤修复、环境监测、环境规划与评价、环境工程设备、生态环境工程、环境工程设计与制图、清洁生产与循环经济等，并以农业环境工程相关课程为特色。现建有禽畜养殖污染控制与资源和技术国家工程实验室华南分中心、广东省高等学校土壤环境与废物资源农业利用重点实验室和广东高校污水生态处理与修复工程技术研究中心等教学实践、科研平台。现有硕士、博士研究生近50人；近5年在土壤重金属污染与修复、农业农村人工湿地污水处理技术、废弃物资源化利用、控释肥料新技术研发、土壤有机污染物迁移转化、城市黑臭河道原位治理、环境生物生态修复等领域已取得显著研究成果。获得国家项目近20项，省自然科学基金和科技计划项目20多项，其它级别与横向课题近30项，总经费超过2000万元。在国内外核心期刊发表150多篇，其中SCI/EI收录论文60多篇。获得国家授权发明专利20多项，出版专著2部。获得国家科学进步二等奖1项（参与）；广东省科学技术二等奖6项；广东省高等教育教学成果一等奖1项。目前有60%的教职人员具有国外留学经历，与法国洛林大学（Université de Lorraine）、美国Rutgers University、美国University of Massachusetts Amherst、美国Ohio State University、英国Langcaster大学等著名高校建立了学术交流合作关系。